En esta fase el ingreso de agua se realiza por la parte superior de un estanque y utilizando capaz de arena y piedra se crea un filtro natural que termina de retener las partículas sólidas que aun presenta el agua.
La etapa de filtración se inicia presionando un sensor de contacto para abrir las compuertas, las cuales llevan una velocidad moderada por la presión de agua que soportan, estas compuertas permanecerán abiertas en tanto el nivel de claridad del agua sea optimo para su ingreso, en caso de alcanzar niveles muy altos de turbiedad las compuertas se cierran.
